B&C 确认《上古卷轴 4：湮没重制版》不支持 MOD，但这并没有阻止忠实粉丝推出一些非官方 MOD。
《上古卷轴 4：湮没重制版》发布仅几个小时后，N 网站（Nexus Mods）上就出现了一些社区 MOD，虽然这些 MOD 大多只是一些小的自定义选项，但这也证明了很少有 MOD 社区像《上古卷轴》粉丝一样热情高涨。
尽管官方并未提供支持，但玩家发现《上古卷轴 IV：湮没重制版》可以像原版游戏一样进行修改：
第一个修改器允许 PC 玩家通过将默认快捷方式替换为著名的“崇拜粉丝”图像之一来个性化他们的桌面。许多模组允许玩家跳过 Bethesda 和 Virtuos 的开场徽标屏幕，而其他模组可以调整《巫师之怒》的魔法并移除指南针。
